經(jīng)過(guò)與一十一（神木隆之介 飾）的惡戰(zhàn)，瀨文焚流（加瀨亮 飾）身受重傷，命幾不保。在此期間，青池里子（栗山千明 飾）隨女兒小潤(rùn)（森山樹(shù) 飾）悄然離開(kāi)醫(yī)院；而各國(guó)政要的一次關(guān)于簡(jiǎn)單計(jì)劃的秘密會(huì)議上，自稱卑彌呼的日本代表抹殺所有人，他代表SPEC持有者正式向普通人類宣戰(zhàn)。世態(tài)險(xiǎn)惡的當(dāng)下，瀨文急急出院，和當(dāng)麻紗綾（戶田惠梨香 飾）一同調(diào)查青池母女的行蹤。而野野村組長(zhǎng)（龍雷太 飾）則獨(dú)自行動(dòng)，查找簡(jiǎn)單計(jì)劃病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替登場(chǎng)，殘酷的殺戮卻從未停止。關(guān)于前人類的秘密昭然若揭，慘烈浩大的人種戰(zhàn)爭(zhēng)即將拉開(kāi)序幕……
　　本片為SPEC系列完結(jié)篇的前篇。